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蛋白質(zhì)結(jié)晶方法
結(jié)晶方法(Crystallization Techniques)1.1.1 分批結(jié)晶(Batch Crystallization) 這是老的簡單的結(jié)晶方法,其原理是同步地在蛋白質(zhì)溶液中加入沉淀劑,立即使溶液達到一個高過飽和狀態(tài)。幸運的話,不需進一步處理即可在過飽和溶液中逐漸長出晶體。一個用于微分批結(jié)晶的自動化系統(tǒng)已被Chayen等人設計出(1991,1992),其微分批方法中,他們在1-2μl包含蛋白質(zhì)和沉淀劑的液滴中生長晶體。液滴被懸浮在油(如石蠟)中,油的作用是作為封層以防止蒸發(fā),它并不干擾普通沉淀劑,但是干擾能溶解油的(Chayen, 1997; see also Chayen, 1998)。
蛋白質(zhì)結(jié)晶涉及四個重要步驟
1. 蛋白質(zhì)純度的確定。如果不夠非常純,必須要進一步純化。
2. 蛋白質(zhì)溶解于合適的溶劑中,從中它能通過一種鹽或有機化合物而析出。溶劑通常是水-緩沖劑溶液,有時加,如2--2,4-(MPD)。正常情況下,沉淀劑也被加入,但是濃度不高于使沉淀產(chǎn)生。對于不溶于水-緩沖劑或水-的膜蛋白,還需要加入去污劑。
3. 使溶液過飽和。在這一步中,小聚集體形成,它是晶體生長所需的核。對小分子的結(jié)晶來說,相比于蛋白質(zhì)更為人熟知,晶核的自發(fā)形成需要提供表面張力能。一旦這個能障被突破了,晶體開始生長。能障在高水平的過飽和度時很容易克服。因此,在高過飽和度時,晶核更易自發(fā)形成。晶核的形成可作為一個過飽和度和其他參數(shù)的函數(shù)通過多種方法來研究,包括光散射、熒光去極化及電子顯微鏡。
4. 一旦晶核形成,晶體生長正式開始。對低分子量的化合物而言,新分子會逐步結(jié)合到正在生長的晶體表面。這是由于這些位置的結(jié)合能比較大,相對于分子結(jié)合到平滑的表面。這些步驟要么由晶系缺陷造成,要么發(fā)生在表面隨機形成的晶核。
蛋白質(zhì)晶體板制作
設計并制作了一種在微腔中對蛋白質(zhì)進行微批量法(microbatch)結(jié)晶的碟式微流控結(jié)晶芯片,它是一種高通量、低成本、低耗樣量(納升級)、操作簡便的蛋白質(zhì)結(jié)晶篩選方法,這種芯片能成功地結(jié)晶溶菌酶(lysozyme)和青色熒光蛋白(CyPet).為了系統(tǒng)地比較這種微流控芯片與傳統(tǒng)的使用蒸汽擴散法的24孔結(jié)晶板的結(jié)晶能力,用3個Hampton結(jié)晶試劑盒,在4℃及20℃培養(yǎng)條件下分別對5種標準蛋白(溶菌酶(lysozyme)、木聚糖酶(xylanase)、脂肪酶B(lipase B)、葡萄糖異構(gòu)酶(glucose isomerase)和嗜熱菌蛋白酶(thermolysin))進行了結(jié)晶篩選實驗.結(jié)果表明,在4℃時微流控芯片與24孔結(jié)晶板有相近數(shù)目的結(jié)晶條件(91 vs 98)。