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PCR出現(xiàn)假陰性
不出現(xiàn)擴增條帶。PCR反應的關鍵環(huán)節(jié)有①模板核酸的制備,②引物的質量與特異性,③酶的質量及Br乙錠的使用, ④PCR循環(huán)條件。尋找原因亦應針對上述環(huán)節(jié)進行分析研究。
模板:①模板中含有雜蛋白質,②模板中含有Taq酶抑制1劑,③模板中蛋白質沒有消化除凈,特別是染色體中的組蛋白,④在提取制備模板時丟失過多,或吸入酚。⑤模板核酸變性不徹底。在酶和引物質量好時,不出現(xiàn)擴增帶,極有可能是標本的消化處理,模板核酸提取過程出了毛病,因而要配制有效而穩(wěn)定的消化處理液,其程序亦應 固定不宜隨意更改。
PCR有哪些應用領域?
基因表達
通??赏ㄟ^PCR來檢測不同細胞類型、組織和生物體在特定時間點的基因表達差異。首先,從目標樣品中分離出RNA并將mRNA逆轉錄成cDNA。隨后,通過由PCR擴增的cDNA數(shù)量,確定mRNA的初始水平。這一過程也被稱為逆轉錄PCR。
梯度PCR儀
把一次性PCR擴增可以設置一系列不同的退火溫度條件(溫度梯度),通常12鐘溫度梯度,這樣的儀器就叫梯度PCR儀。
工作模式和原理同普通PCR儀一樣,它出了又普通PCR儀的功能外還多了一個梯度退火功能。DNA部分片段的擴增對溫度的控制精度要求特別高,不同的DNA部分片段其退火溫度不一樣,通過計算DNA部分片段中的CG堿基的含量只能初步的判斷出zui優(yōu)退火溫度在 5℃范圍內,如果用普通PCR儀進行研究,需重復擴增很多次,然后做電泳進行分析來確定zui優(yōu)退火溫度。而梯度PCR儀則只需要一次就可以完成,在節(jié)省了時間的同時提高了實驗的可靠性和準確性。主要用于研究未知DNA退火溫度的擴增,這樣節(jié)約成本的同時也節(jié)約了時間和經(jīng)費。在不設置梯度的情況下,梯度PCR儀也可以做普通PCR擴增。
該儀器主要應用于科研,教學機構,醫(yī)學臨床研究,高等院校,病毒分析,疾控中心等。